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生物工程，是20世纪70年代初开始兴起的一门新兴的综合性应用学科，90年代诞生了基于系统论的生物工程，即系统生物工程的概念所谓生物工程，一般认为是以生物学（特别是其中的微生物学、遗传学、生物化学和细胞学）的理论和技术为基础，结合化工、机械、电子计算机等现代工程技术，充分运用分子生物学的最新成就，自觉地操纵遗传物质，定向地改造生物或其功能，短期内创造出具有超 远缘性状的新物种，再通过合适的生物反应器对这类“工程菌”或“工程细胞株”进行大规模的培养，以生产大量有用代谢产物或发挥它们独特生理功能一门新兴技术。
开设这门专业的学校有：
浙江省：浙江万里学院、浙江大学、浙江工业大学、浙江科技学院、宁波大学、浙江工商大学、中国计量学院、浙江中医学院、浙江科技学院、湖州师范学院、台州学院、嘉兴学院
北京：北京航空航天大学、中国农业大学、北京理工大学、北京化工大学、北京工商大学、北京联合大学、首都师范大学、北京师范大学、北京化工大学、北京工业大学、北京农学院
天津：天津大学、天津理工大学、天津科技大学、天津商业大学、天津天狮学院、天津农学院
上海：复旦大学、上海交通大学、华东理工大学、上海大学、东华大学
重庆：重庆大学、西南大学、重庆工商大学、重庆理工大学
河北：燕山大学、河北大学、河北工业大学、河北农业大学、河北化工医药学院、河北经贸大学
河南：郑州大学、周口师范学院、平顶山工学院、河南大学、河南师范大学、河南农业大学、河南工业大学、郑州轻工业学院、南阳师范学院、河南科技学院、商丘师范学院、河南科技大学
山东：山东轻工业学院、山东大学、中国海洋大学、青岛科技大学、山东农业大学、山东科技大学、曲阜师范大学、山东理工大学、青岛科技大学、聊城大学、烟台大学、鲁东大学（原烟台师范学院） 、青岛农业大学、山东建筑大学、菏泽学院、泰山医学院、聊城大学东昌学院、德州学院
山西：太原工业学院、山西大学、太原理工大学、中北大学、山西农业大学
安徽：合肥工业大学、安徽大学、淮北师范大学、安徽工程大学、安徽技术师范学院、合肥学院蚌埠学院
江西：南昌大学、江西师范大学、江西农业大学、江西理工大学、江西中医学院、宜春学院、东华理工大学
江苏：江苏科技大学、扬州大学、东南大学、中国矿业大学、苏州大学、常州大学、南京理工大学、南京农业大学、南京工业大学、江南大学、中国药科大学、南京林业大学、淮海工学院、徐州工程学院、盐城工学院、盐城师范学院、南通大学
湖北：湖北生物科技职业学院、华中科技大学、华中农业大学、湖北大学、长江大学、武汉科技大学、三峡大学、中南民族大学、湖北工业大学、武汉工程大学、武汉科技学院、武汉工业学院、湖北民族学院、孝感学院、武汉生物工程学院、荆楚理工学院、武汉工商学院
湖南：中南大学、中南林业科技大学、湘潭大学、长沙理工大学、湖南农业大学、长沙大学、湖南城市学院、吉首大学、湖南理工学院、湖南中医学院、湖南工程学院、邵阳学院、怀化学院、湖南科技学院、湖南科技大学/湖南环境生物学院
广东：中山大学、广东石油化工学院、华南理工大学、华南师范大学、华南农业大学、广东工业大学、广东海洋大学、广州大学、仲恺农业工程学院、广东医学院、广州医学院、嘉应学院、深圳大学
广西：广西大学、桂林电子科技大学[1]
云南：昆明理工大学
贵州：贵州大学、贵州工业大学、遵义医学院
四川：四川大学、成都大学、西南交通大学、成都理工大学、西南科技大学、西南石油大学、四川农业大学、西华大学、四川理工学院、宜宾学院、攀枝花学院
陕西：西安交通大学、西安工程大学、西北大学、西北农林科技大学、陕西科技大学、陕西理工学院、西安生物医药学院、陕西学前师范学院
黑龙江：哈尔滨工业大学、黑龙江大学、东北林业大学、东北农业大学、齐齐哈尔大学、哈尔滨商业大学、黑龙江八一农垦大学
吉林：吉林大学、长春理工大学、吉林农业大学、延边大学、长春工业大学、东北电力大学、吉林工程技术师范学院、吉林化工学院、东北师范大学、吉林医药学院、北华大学、长春大学
辽宁：大连工业大学、大连理工大学、东北大学、沈阳农业大学、沈阳药科大学、沈阳大学、辽宁石油化工大学、辽宁科技大学、大连大学、沈阳化工学院、大连民族学院
新疆：新疆大学
内蒙古：内蒙古大学、内蒙古农业大学、内蒙古科技大学、内蒙古工业大学
海南：海南大学
福建：厦门大学、福州大学、福建师范大学、华侨大学、集美大学、福建师范大学闽南科技学院、福州大学至诚学院
甘肃：兰州理工大学、兰州交通大学、甘肃农业大学、西北民族大学
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